大肠肝菌穿过粘液层进入结肠粘膜上皮细胞，不断分裂繁殖，并产生大量外毒素。外毒素随血液及组织液侵入到肠粘膜组织中；结肠粘膜免疫细胞释放抗体，准备杀灭大肠杆菌外毒素，但由外毒素躲藏在结肠粘膜组织细胞中，因而这一过程使大批的肠粘膜细胞被破坏；肠粘膜细胞在被破坏中，产生大量溶酶体酶，使更多的细胞受损，粘膜产生炎症，溃烂、水肿。服用抗生素后，使大肠肝菌暂时受到抑制，但令大批有益菌群遭到杀灭，使急性肠炎失去了“菌群屏障”大批新的大肠肝菌入侵；反复感染，急性肠炎顽固不愈。

 

　　治疗急性肠炎的关键在于预防，结合急性肠炎的病因，做好急性肠炎的预防工作，是远离急性肠炎的最有效的方法。